Nameco는 Nanopore 시퀀싱 데이터를 기반으로 세균 분류를 지원하는 오픈소스 소프트웨어입니다. Oxford Nanopore Technologies(ONT)에서 직접 개발한 것은 아니지만, Nanopore의 롱리드 16S 시퀀싱 데이터를 분석하는 데 최적화되어 있습니다.
Nameco는 주로
- 다수의 리드를 클러스터링하고,
- 클러스터별로 정확한 컨센서스 서열을 만들어,
- 속(genus)과 종(species) 수준까지 세균을 분류할 수 있게 도와줍니다.
https://github.com/timyerg/NaMeco
'나노포어 어플리케이션 > 커스텀 프로토콜' 카테고리의 다른 글
BugSeq 16S: NanoCLUST with Improved Consensus Sequence Classification (0) | 2025.04.29 |
---|---|
[Poster] CZ ID × Nanopore: 누구나 쉽게 활용 가능한 클라우드 기반 메타지노믹스 분석 (0) | 2025.04.25 |
식물 유래 초장기(ultra-long) DNA 추출 프로토콜 소개 (0) | 2025.04.08 |
PrimalScheme – 타겟 유전체 증폭용 프라이머 설계 도구 (0) | 2025.04.08 |
RNA Flow Cells Washing Protocol (Unofficial) (0) | 2025.03.27 |