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나노포어 어플리케이션/커스텀 프로토콜

[Poster] CZ ID × Nanopore: 누구나 쉽게 활용 가능한 클라우드 기반 메타지노믹스 분석

by youngmun 2025. 4. 25.

CZ ID는 오픈소스 기반의 클라우드 분석 플랫폼으로, 이제 Oxford Nanopore 데이터까지 자동으로 분석 가능한 메타지노믹스 모듈을 제공합니다. 복잡한 설치 없이 웹 브라우저에서 FASTQ 파일만 업로드하면 감염병 원인체 탐지부터 마이크로바이옴 분석까지 가능합니다.


CZ ID Nanopore 모듈이란?

새로운 CZ ID Nanopore metagenomics module은 ONT 시퀀싱 데이터를 클라우드에서 직접 업로드하고 자동으로 분석할 수 있도록 설계되었습니다. 전 세계 어디서든 무료로 사용할 수 있으며, 감염병 대응, 미지의 병원체 탐지, 환경 마이크로바이옴 분석 등 다양한 분야에 적용할 수 있습니다.


CZ ID Nanopore 분석 파이프라인

단계 설명
Host Filtering & QC 품질 필터링, 숙주 유전체 제거 (minimap2, fastp)
Assembly & Alignment 메타지노믹 조립 → NCBI NT/NR 데이터베이스 정렬 (DIAMOND, minimap2)
Taxonomic Reporting 각 컨티그의 정렬 결과를 바탕으로 종/균주 레벨 분류

조립된 서열뿐 아니라 조립되지 않은 리드도 병렬로 분석
종별 총 리드 수 및 염기수 통계 제공


Divergent Virus도 탐지 가능

  • 40~50% 변이된 바이러스 유전체도 탐지 가능 (SARS-CoV-2, Marburg 등)
  • 단백질 서열 기반 정렬을 통해 기존 도구로는 감지 불가능한 병원체까지 탐지
  • 결론: CZ ID는 단백질 수준에서 정렬 가능한 유일한 무료 도구


직관적인 사용자 인터페이스 (UI)

  • 샘플 업로드 → 분석 타입 선택 → 분석 결과 자동 생성
  • 프로젝트/샘플별 데이터 관리 기능 제공
  • 리포트에는 다음 항목이 포함됨:
    • 검출된 종 (taxa)
    • 종별 상대적 abundance
    • 유전체 커버리지 시각화
    • Taxonomic tree view


주요 기능 비교

기능 (Feature) CZ ID EDGE BV-BRC INSaFLU
Host filter (숙주 유전체 제거)
Assembly (유전체 조립)
Species info (종 정보 제공)
Filter report (필터링 보고서)
BLAST 검색
Taxon ID (nucleotide 기반 분류)
Taxon ID (protein 기반 분류)
Pathogen tag (병원체 표시 기능)
Coverage visualization (유전체 커버리지 시각화)
Alignment visualization (정렬 결과 시각화)

앞으로 제공될 기능 (Coming Soon)

  • 샘플 간 비교 Heatmap 시각화 기능
  • 특정 병원체/기능 유전자 기준으로 필터링 및 분류 가능


정리

CZ ID는 누구나 쉽게 사용할 수 있는 무료 메타지노믹스 분석 플랫폼입니다. 특히 Nanopore 데이터를 활용한 감염병 탐지 및 미생물군집 분석에 강력하며, 임상, 공공보건, 연구 환경 모두에 적합합니다.