long read single cell2 롱리드 기반 싱글셀 및 공간 유전체 분석: 아이소폼 수준까지의 정밀 해석 Alternative transcript isoform detection with single cell and spatial resolution ONT PromethION 플랫폼을 활용한 싱글셀 및 Visium 공간 전사체 분석을 통해, 기존의 쇼트리드 기반 분석법보다 훨씬 정밀하게 아이소폼(isoform) 수준에서 유전자 발현을 분해할 수 있음을 보여준 연구 결과를 소개합니다.연구 목적기존 short-read 기반 single cell 분석의 한계→ 유전자 수준까지만 해석 가능, 아이소폼 구분 어려움이번 연구는 Oxford Nanopore의 롱리드 시퀀싱(PromethION) 기술을 사용하여 세포별 및 공간별로 대체 전사체 아이소폼을 정확히 식별할 수 있음을 입증실험 구성 요약 1. 샘플 종류PBMC .. 2025. 4. 22. 나노포어 시퀀싱을 이용한 single cell full-length isoform 분석 Obtaining full-length isoforms from single cells with Oxford Nanopore sequencing 단일세포에서 full-length isoform 얻기: Oxford Nanopore 시퀀싱을 활용한 통합 분석 단일 세포 수준에서 전사체(Transcriptome)를 분석하면, 세포별 전사체 조절, 신경질환, 암 등 다양한 질환의 세포 특이적 메커니즘을 이해하는 데 큰 도움을 줍니다. 하지만 기존의 단편 시퀀싱(short-read)은 시퀀스 길이 제한 때문에 스플라이싱 변이, 동일 유전자의 다양한 isoform, SNP 등을 충분히 해석하기 어렵다는 한계가 있었습니다. Oxford Nanopore의 장편 시퀀싱 기술은 이런 제약을 극복하고, 단일 세포에서 ful.. 2025. 3. 31. 이전 1 다음
