나노포어3 베이스콜링용 GPU 성능 비교: 어떤 GPU가 PromethION에 적합할까? https://github.com/Kirk3gaard/2025-Crowdsource-GPU-basecalling-stats GitHub - Kirk3gaard/2025-Crowdsource-GPU-basecalling-stats: A repository for collecting GPU basecalling statsA repository for collecting GPU basecalling stats. Contribute to Kirk3gaard/2025-Crowdsource-GPU-basecalling-stats development by creating an account on GitHub.github.com Dorado 기반 나노포어 베이스콜링을 위한 GPU 성능 비교 자료가 공개되었습니다.Pr.. 2025. 4. 25. Nanopore Sequencing for Microbiology & Infectious Diseases 공공 보건, 식품 안전, 임상 연구에서 병원성 미생물의 확산을 방지하기 위해서는 미생물의 빠르고 정확한 식별 및 특성 분석이 매우 중요합니다. 나노포어 시퀀싱은 완전한 미생물 유전체를 생성함으로써, 감염병 발생 조사, 항생제 내성(AMR) 감시, 식품 품질 모니터링, 신제품 개발 등 다양한 분야에서 풍부한 미생물 정보를 제공합니다. 이 브로셔에서는 기존 short-read 기술의 한계를 극복하고 미생물 유전체를 포괄적으로 분석할 수 있는 나노포어 시퀀싱 기술에 대해 확인하실 수 있습니다. 2025. 3. 24. Direct RNA Sequencing (modifications with PCR-free) Detecting isoforms and RNA modifications with PCR-free, direct RNA nanopore sequencing나노포어 Direct RNA Sequencing, 전사체를 '있는 그대로' 읽는 기술가공 없는, 진짜 RNA를 직접 시퀀싱하다Oxford Nanopore의 Direct RNA 시퀀싱 기술 소개기존 RNA 시퀀싱은 RNA를 직접 읽는 것이 아니라, 먼저 cDNA로 변환한 후 시퀀싱을 진행합니다. 이 과정에는 역전사(reverse transcription)와 PCR 증폭 같은 전처리 과정이 필요하지만, 이로 인해 중요한 정보가 왜곡되거나 소실될 위험이 존재합니다.예를 들어:역전사 과정 중 메틸화(methylation) 정보가 사라질 수 있음특정 서열이 잘 .. 2025. 3. 21. 이전 1 다음
