single cell5 [Single Cell] 롱리드로 완성한 뇌 전사체 지도: 발달기와 성체의 스플라이싱 차이 Single-cell long-read sequencing-based mapping reveals specialized splicing patterns in developing and adult mouse and human brain 이 논문은 뇌의 발달 단계별·세포 타입별 스플라이싱 패턴을 전장(long-read) 수준에서 직접 규명한 최초의 연구 중 하나입니다. 기존 short-read RNA-seq은 전사체를 짧게 잘라 읽기 때문에 각 세포가 실제로 어떤 isoform(전사체 구조)을 사용하는지 정확히 보기 어려웠습니다. 그러나 이 연구에서는 long-read 기술을 이용해 RNA의 전체 길이를 그대로 읽어, 개별 세포가 생성하는 전사체를 “직접 관찰”함으로써 새로운 생물학적 인사이트를 얻었습니다... 2025. 12. 18. [응용 사례] Long-read로 확장하는 싱글셀 RNA 시퀀싱의 새로운 가능성 Long-read 기반 싱글셀 RNA 시퀀싱 — 왜 필요한가? [링크] Taking your single-cell sequencing to new lengths with Oxford NanoporeTaking your single-cell sequencing to new lengths with Oxford Nanopore | Welcome to Oxford Nanopore technologies. Our goal is to enable the analysis of any living thing, by any person, in any environmentnanoporetech.com 최근 싱글셀(single-cell) 및 공간 전사체(spatial) 분석 기술은 전사체 연구의 혁신을 가져오며, 연구자들이.. 2025. 12. 18. [Single-cell] Long-read 기반 Full-length Isoform 분석 워크플로우 Obtaining full-length isoforms from single cells with Oxford Nanopore sequencing 단일세포에서 full-length isoform 얻기: Oxford Nanopore 시퀀싱을 활용한 통합 분석 단일 세포 수준에서 전사체(Transcriptome)를 분석하면, 세포별 전사체 조절, 신경질환, 암 등 다양한 질환의 세포 특이적 메커니즘을 이해하는 데 큰 도움을 줍니다. 하지만 기존의 단편 시퀀싱(short-read)은 시퀀스 길이 제한 때문에 스플라이싱 변이, 동일 유전자의 다양한 isoform, SNP 등을 충분히 해석하기 어렵다는 한계가 있었습니다. Oxford Nanopore의 장편 시퀀싱 기술은 이런 제약을 극복하고, 단일 세포에서 ful.. 2025. 12. 4. [Single Cell] Nanopore × 10x Genomics — 싱글셀 전사체 분석을 위한 호환성 확장 발표 확장된 협업을 통해 싱글셀 분석에서 더 풍부하고 비용 효율적인 생물학적 인사이트 제공 Oxford Nanopore Technologies는 오늘 10x Genomics, Inc.와의 협업 확대를 발표했습니다.이번 협업을 통해 양사의 최신 기술 간 완벽한 호환성이 확보되었으며,이를 통해 더 정확하고 비용 효율적이며 접근성 높은 단일세포 전사체 분석(single-cell transcriptomics)이 가능해졌습니다.이번에 인증된 호환성은 다음과 같습니다:10x Genomics의 최신 Chromium Universal GEM-X 3’ 및 GEM-X 5’ 싱글셀 시약(높은 민감도 유지하면서 세포당 비용 절감)Oxford Nanopore의 고정확도 V14 chemistry이 통합으로 연구자들은 full-leng.. 2025. 5. 9. [Single-cell] 나노포어 기반 full-length isoform 분석 가이드 Obtaining full-length isoforms from single cells with Oxford Nanopore sequencing 단일세포에서 full-length isoform 얻기: Oxford Nanopore 시퀀싱을 활용한 통합 분석 단일 세포 수준에서 전사체(Transcriptome)를 분석하면, 세포별 전사체 조절, 신경질환, 암 등 다양한 질환의 세포 특이적 메커니즘을 이해하는 데 큰 도움을 줍니다. 하지만 기존의 단편 시퀀싱(short-read)은 시퀀스 길이 제한 때문에 스플라이싱 변이, 동일 유전자의 다양한 isoform, SNP 등을 충분히 해석하기 어렵다는 한계가 있었습니다. Oxford Nanopore의 장편 시퀀싱 기술은 이런 제약을 극복하고, 단일 세포에서 ful.. 2025. 3. 31. 이전 1 다음
