박테리아 종에서의 나노포어 시퀀싱 재현성 향상, 정확도 개선 입증

 High intra-laboratory reproducibility of nanopore sequencing in bacterial species underscores advances in its accuracy

 

나노포어 시퀀싱은 휴대성, 실시간 분석, 긴 리드 생성이라는 강점으로 주목받는 3세대 시퀀싱 기술입니다.

 

이번 연구에서는 오픈소스 워크플로우(nanobacta)를 활용해 Oxford Nanopore 데이터를 자동으로 조립하고, 동일한 박테리아 DNA 샘플에 대해 8개의 반복 실험을 수행하여 재현성을 평가했습니다.

 

그 결과, short-read 없이도 나노포어 전용 조립에서 99.999955%, polishing 적용 시 99.999996%의 높은 정확도를 기록했습니다. 항생제 내성 유전자, 분류학적 정보, core genome SNP 및 MLST 분석에서도 나노포어 데이터만으로 높은 일관성과 정확성이 확인되었습니다.

 

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